ADN ligase (ATP ou NAD+) EC# : 6.5.1.6 ; ChemWhat Code: 1383898
| Nom du produit | ADN ligase (ATP ou NAD +) |
| Exemple de structure | ![]() |
| synonymes | ADN ligase de Tfu |
| Numéro CE | 6.5.1.6 |
| Numéro de registre CAS | |
| Commentaires | Les enzymes des archées «Thermococcus fumicolans» et «Thermococcus onnurineus» présentent une activité élevée avec l'ATP ou le NAD +, et une activité significativement plus faible avec le TTP, le GTP et le CTP. L'enzyme catalyse la ligature des brins d'ADN avec des extrémités 3'-hydroxyle et 5'-phosphate, formant un phosphodiester et scellant certains types de cassures monocaténaires dans l'ADN duplex. La catalyse se produit par un mécanisme en trois étapes, commençant par l'activation de l'enzyme par l'ATP ou le NAD +, formant une liaison phosphoramide entre l'adénylate et un résidu lysine. Le groupe adénylate est ensuite transféré à l'extrémité 5'-phosphate du substrat, formant la structure coiffée 5 '- (5'-diphosphoadénosine) - [ADN]. Enfin, l'enzyme catalyse une attaque nucléophile de l'extrémité 3'-OH sur l'extrémité coiffée, qui se traduit par la formation de la liaison phosphodiester et la libération de l'adénylate. Différent de EC ™ 6.5.1.1, ADN ligase (ATP), EC ™ 6.5.1.2, ADN ligase (NAD +) et EC ™ 6.5.1.7, ADN ligase (ATP, ADP ou GTP). |
| Cofacteur | |
| Histoire | |
| Réactions | (1) Atp + (désoxyribonucléotide) (n) -3'-hydroxyl + 5'-phospho- (désoxyribonucléotide) (m) = (désoxyribonucléotide) (n + m) + Amp + diphosphate. (2) NAD (+) + (désoxyribonucléotide) (n) -3′-hydroxyl + 5′-phospho- (désoxyribonucléotide) (m) = (désoxyribonucléotide) (n + m) + Amp + bêta-nicotinamide D-nucléotide. |
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