ADN ligase (ATP, ADP ou GTP) EC #: 6.5.1.7

Nom du produit ADN ligase (ATP, ADP ou GTP)
Exemple de structure Exemple de structure de l'ADN ligase (ATP, ADP ou GTP) EC #: 6.5.1.7
synonymes Hbu ADN ligase, ADN ligase à cofacteurs multiples, Szi ADN ligase
Numéro CE 6.5.1.7
Numéro de registre CAS
Commentaires Les enzymes des archées «Hyperthermus butylicus» et «Sulfophobococcus zilligii» sont actives avec l'ATP, l'ADP ou le GTP. Ils ne montrent aucune activité avec NAD +. L'enzyme catalyse la ligature des brins d'ADN avec des extrémités 3'-hydroxyle et 5'-phosphate, formant un phosphodiester et scellant certains types de cassures monocaténaires dans l'ADN duplex. La catalyse se produit par un mécanisme en trois étapes, commençant par l'activation de l'enzyme par l'ATP, l'ADP ou le GTP, formant une liaison phosphoramide entre l'adénylate / guanylate et un résidu de lysine. Le nucléotide est ensuite transféré à l'extrémité 5'-phosphate du substrat, formant la structure coiffée 5 '- (5'-diphosphoadénosine / guanosine) - [ADN]. Enfin, l'enzyme catalyse une attaque nucléophile de l'extrémité 3'-OH sur l'extrémité coiffée, ce qui entraîne la formation de la liaison phosphodiester et la libération du nucléotide. Différent de EC ™ 6.5.1.1, ADN ligase (ATP) et EC ™ 6.5.1.6, ADN ligase (ATP ou NAD +), qui ne peut pas utiliser GTP.
Cofacteur
Histoire
Réactions (1) Atp + (désoxyribonucléotide) (n) -3'-hydroxyl + 5'-phospho- (désoxyribonucléotide) (m) = (désoxyribonucléotide) (n + m) + Amp + diphosphate. (2) Adp + (désoxyribonucléotide) (n) -3'-hydroxyle + 5'-phospho- (désoxyribonucléotide) (m) = (désoxyribonucléotide) (n + m) + Amp + phosphate. (3) Gtp + (désoxyribonucléotide) (n) -3'-hydroxyl + 5'-phospho- (désoxyribonucléotide) (m) = (désoxyribonucléotide) (n + m) + Gmp + diphosphate.

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