Nom du produit |
Ligase d'acide nucléique 3′-phosphate / 5′-hydroxy |
Exemple de structure |
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synonymes |
3′-P RNL, MXAN_0280, MXAN_4982, ligase d'épissage d'ARN, rtcB, ARN ligase de RtcB, Rtcb-1, RtcB1, Trl1, ligase d'épissage d'ARNt, ligase d'épissage d'ARNt |
Numéro CE |
6.5.1.8 |
Numéro de registre CAS |
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Commentaires |
L'enzyme est une ligase d'acide nucléique 2'-3 'dépendante du GTP et du Mn5 +, avec la capacité de joindre l'ARN avec des extrémités 3'-phosphate ou 2', 3'-phosphate cyclique à un ARN avec des extrémités 5'-hydroxy. Il peut également joindre l'ADN avec des extrémités 3'-phosphate à l'ADN avec des extrémités 5'-hydroxy, à condition que les extrémités d'ADN ne soient pas appariées [6]. L'enzyme se trouve dans les membres des trois règnes de la vie et est essentielle dans les métazoaires pour l'épissage des ARNt contenant des introns. La réaction suit un mécanisme en trois étapes avec l'activation initiale de l'enzyme par hydrolyse du GTP, formant une liaison phosphoramide entre le guanylate et un résidu histidine. Le groupe guanylate est transféré à l'extrémité 3'-phosphate du substrat, formant la structure coiffée [ADN / ARN] -3 '- (5'-diphosphoguanosine). Lorsqu'une extrémité 5'-OH appropriée est disponible, l'enzyme catalyse une attaque du 5'-OH sur l'extrémité coiffée pour former une jonction d'épissure phosphodiester 3'-5 ', libérant le guanylate. Lorsqu'elle agit sur un ARN 2 ', 3'-phosphate cyclique, l'enzyme procède à une réaction supplémentaire, hydrolysant le phosphate cyclique en 3'-phosphate [9]. L'enzyme métazoaire nécessite des cofacteurs activateurs afin de réaliser une catalyse de renouvellement multiple [8]. |
Cofacteur |
Mn2 + |
Histoire |
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Réactions |
(1) (ribonucléotide) (n) -3'-phosphate + 5'-hydroxy- (ribonucléotide) (m) + Gtp = (ribonucléotide) (n + m) + gmp + diphosphate. (2) (Ribonucléotide) (n) -2 ′, 3′-cyclophosphate + 5′-hydroxy- (ribonucléotide) (m) + Gtp + H (2) O = (ribonucléotide) (n + m) + gmp + diphosphate (réaction globale). |